Herausforderung
Verständliche und intuitive Bereitstellung von aufbereiteten Daten für unterschiedliche Zielgruppen aus dem Gesundheitssektor
Ziel
Optimierung der ANRESIS-Dashboards hinsichtlich Performance und Intuitivität für die Nutzenden
Lösung
Ganzheitliche Unterstützung durch eoda - von der Entwicklung bis zum produktiven Betrieb
Ausgangssituation
ANRESIS, das Schweizerische Zentrum für Antibiotikaresistenzen ist ein repräsentatives, nationales Überwachungssystem und Forschungsinstrument für Antibiotikaresistenzen und Antibiotikakonsum (anresis.ch). ANRESIS wird im Auftrag des Bundesamtes für Gesundheit (BAG) betrieben.
Zu den Aufgaben von ANRESIS gehört es, Resistenzdaten aus Routinediagnostiken zu sammeln und die aufbereiteten und aggregierten Daten sowohl für die Öffentlichkeit als auch für Behörden, Spitäler/Krankenhäuser, die Ärzteschaft und interessierte Forschungsgruppen bereitzustellen.
Für die Datenbereitstellung setzt ANRESIS auf das Framework R Shiny. Shiny bietet die Möglichkeit aus der Open Source Sprache R heraus, Daten und Datenanalysen einfach und intuitiv bereitzustellen.
Ziel
Das Ziel war die die umfassende Modernisierung der ANRESIS-Dashboards. Durch die Implementierung mittels R Shiny sollte die Datenbereitstellung professionalisiert werden, wobei die Optimierung der Performance sowie eine verbesserte Intuitivität der Anwendungen für Labore und Spitäler/Krankenhäuser im Fokus standen.
Lösung
ANRESIS setzt für die Erreichung dieses Ziels auf die führende R- und Shiny-Expertise der eoda. eoda unterstützt im Rahmen seines Empowerment-Ansatzes ANRESIS ganzheitlich bei der Weiterentwicklung der R Shiny-Dashboards:
- Wissenstransfer: eoda hat die Mitarbeitenden von ANRESIS in der Entwicklung von Shiny-Apps für Produktivumgebungen und in diesem Zuge in DevOps-Themen mit GitLab geschult. In Pair-Programming Sessions wurde zusätzlich die Wissensvermittlung mit der Erarbeitung produktiver Applikationen verknüpft. Dabei stand neben Best Practices zum Aufbau reproduzierbarer Umgebungen (R-Paket renv) unter anderem auch die Einbindung interaktiver Kartenmodule und die Entwicklung von Templates im Corporate Design im Fokus.
- Entwicklungsleistungen: eoda hat die bei ANRESIS bereits bestehenden Shiny-Applikationen weiterentwickelt. Da die Daten teilweise institutionsspezifisch und vertraulich sind, war ein zentraler Baustein dabei das Authentifizierungssystem mit Benutzergruppen/-rollen, welches um zusätzliche Funktionalitäten rund um die Passwortverwaltung sowie einen Authentifizierungsworkflow erweitert wurde.
- Deployment & Hosting: Im Rahmen der Unterstützungsleistung hat eoda ANRESIS auch bei der Optimierung des Deployments und des Hostings der Shiny-Applikationen auf ihrer Infrastruktur unterstützt.
Dashboards für individuelle Labor- und Krankenhaus-/Spitaldaten
Wie entwickelt sich der Antibiotikakonsum? Welche Antibiotikaresistenzen bestehen? Die ANRESIS R Shiny-Dashboards geben Laboren und Krankenhäusern / Spitälern die richtigen Antworten auf diese und viele weitere Fragen. Dafür verfügen die Dashboards über einen personalisierten Log-in, der den Nutzenden Zugriff auf die labor-/krankenhaus-/spital-eigenen Daten ermöglicht. Für einen Gesamtüberblick werden die Daten anderer Organisationen in anonymisierten Benchmark-Reports dargestellt. Das Resistenz-Dashboard ist modular aufgebaut und ermöglicht neben Standardanalysen, wie der institutsinternen Resistenzstatistik oder Erregerverteilung auch die Darstellung longitudinaler Resistenztrends – parametrisiert nach einzelnen Abteilungen oder Probetypen.
Ergebnis
Für viele WissenschaftlerInnen ist R Shiny das führende Framework, um Erkenntnisse aus der Erhebung von Überwachungsdaten, Studien und Forschungsprojekten zu teilen – so auch für ANRESIS. Performance, Funktionsumfang, Usability: Durch die Zusammenarbeit mit eoda hat ANRESIS seine R Shiny-Dashboards entscheidend optimiert und durch den Wissensaufbau die Grundlage geschaffen, um in Zukunft eigenständig Dashboards zu entwickeln, die den hohen Ansprüchen des ANRESIS-Netzwerks entsprechen und damit einen wertvollen Beitrag zur kontinuierlichen Überwachung von Antibiotikaresistenz und -konsum leisten.
„Die Zusammenarbeit mit eoda ist für uns ein echter Mehrwert: Fundierte technische Expertise, verständliche Wissensvermittlung und ein tiefes Verständnis für unsere fachlichen Anforderungen - von der App-Entwicklung bis zum produktiven Betrieb“
Dr. Michael Gasser | Epidemiologe | Schweizerisches Zentrum für Antibiotikaresistenzen ANRESIS
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